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30款生物医学常用软件,(pcr引物设计、文献管理、流程图绘制...)

时间:2020-06-03 18:35 点击次数: 更多 pcr引物设计 文章
 生物医学研究领域中常用专业软件共计30款,百度搜不到建议淘宝。

按照软件功能分类,共分为8类

1.文献管理与分析
2.分子生物学综合软件
3.大分子二维/三维结构绘图软件
4.质粒绘图软件
5.引物设计软件
6.凝胶分析软件
7.代谢网络和信号传导分析软件
8.流程图绘制软件

接下来给大家列出每个类别下具体的软件名称

1、文献管理与分析

EndNoteX7,文献管理软件,平时方便论文管理,写文章的时候插入文献也是相当的方便;
RefViz2.1,文献分析软件,与EndNote结合使用,分析文献,可以省掉大把自己看自己归纳的时间;
NoteExpress,国内最专业的文献检索与管理系统,完全支持中文,NoteExpress可以帮助您通过各种方途径高效,自动的搜索(含互联网),下载,管理文献资料和论文;

2、分子生物学综合软件

Vector NTI 11.5.1,分子生物学的综合软件,什么功能几乎都全了;
BioEdit7.0.9.0,杂七杂八的功能凑在一起的一个分子生物学软件,有些罕见的Vector NTI所所没有的功能;
DNAMAN 6.0,与Vector NTI类似的一个软件,但是图型化上做的很差,集成度和序列的管理功能比Vector NTI差的不是一点点,罕用,但有时候有些序列的格式非得要用它的样子排,没有办法;
DNAstar v7.1,核弹级综合性序列工具软件,功能很广,名气很大。囊括分子生物学领域大多数内容;
SSRHunter 1.3 ,南京农大金陵研究院李强编写的SSR ( Simple SequenceRepeat,即简单序列重复,又称微卫星DNA )位点查找软件;
chromas ,基因测序峰图查看软件;
3、大分子二维和三维结构绘图软件
PyMol 0.99 ,是一个处理分子结构的软件,经常用在蛋白质的结构分析上面的神奇的就在于它可以编辑小范围内的结构;
DeepView ,曾经叫做Sus-PdbViewer,是由瑞士日内瓦分子生物服务證的ExPASy设计的,也叫DV或SPV ,是一种界面友好,基于计算机应用,功能强大的三维图形软件工具。
RNA Draw 1.1 , RNA和DNA二级结构的分析软件,可以分析做PCR的时候的引物的二聚体,更直观一些;
4、质粒绘图软件
SimVector4.6:与PrimerPremier同一家公司的软件,画质粒的一个软件,效果还行,与VectorNTI画出来的风格不一样,有的杂志喜欢;
bvplasmid:质粒绘图免费软件;
Winplas:是一个质粒绘图的专业软件,功能强大,而且极易上手,它可以绘制出具有发表质量的质粒图谱。可广范应用于论文、教程的质粒插图;

5、引物设计软件
Primerpremier5,引物设计软件,大家都用,我也用;
Oligo7.37,引物设计软件,大家都用,我还用,设计FusionPCR和In-Fusion连接的引物的时候,比Primerpremier直观一些,内附注册机,可用;
PrimerExpress3.0,由ABI公司设计开发,是Real-timePCR引物设计强大工具,3.0版本设计的引物能适用于不同品牌大部分的机型;
FastPCR5.4,一款快速设计各种类型PCR引物(简并引物),还包括一些常用的DNA与蛋白序列软件工具。

6、凝胶分析软件
BandScan5.0,是一个很常用的凝胶图像分析软件,可用于琼脂糖凝胶电泳,SDS-PAGE及及转到膜上的WesternBlot,NorthernBlot,EMSA等的相对定量分析;
QuantiScanv3.0,使用简单功能专一的凝胶扫描、分析软件;
QuantityOne4.6.2,BioRad的凝胶成像仪自带的电泳图像软件,算很好上手的了;
Gel-Proanalyzer,是由美国MediaCybernetics公司所推出的专业图像分析软件。软件功能强大,单向电泳分析专家自动化程度高,高效泳道识别,分析数据无缝连接EXCEL数据文件。自带可编程数据库。可分析菌落记数、斑点杂交;
PDQuest8.0.1Advance,Bio-Rad公司推出的PDQuest分析软件,含5种功能:成像系统控制功能+二维凝胶分析功能+数据库管理功能+SpotCutter切胶系统控制功能+质谱数据反馈功能;
imagelab3.0,从BIO-RAD公司培训人员那搞到的凝胶图形分析软件。据说是目前存在的唯一可以用的免费imagelab软件,而且是中文版的,同时兼容不同类型的电脑系统。

7、代谢网络和信号传导分析软件
CellNetAnalyzer6.0,以前叫FluxAnalyzer,基于MatLab的代谢网络和信号传导网络分析模块,大部分论文中的代谢网络分析都是或明或暗的用这个分析的;
Pathway_Builder_Tool,信号通路画图软件;

8、流程图绘制软件
SmartDraw11,画流程图和一些复杂的示意图;
ConceptDraw7.5Professional,SmartDraw在接下来一段时间内的强有力的竞争对手;

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